Fernandez ha ricevuto i gradi Licenza in Chimica (1979) e Matematica (1980) dalla Universidad Nacional del Sur, Argentina.[1] Ha poi conseguito un dottorato in chimica fisica dalla Yale University, Stati Uniti d'America, nel 1984[2] nel laboratorio di Oktay Sinanoğlu. Le sue articoli presto pubblicati[3] lo elencano anche come associati con il Weizmann Institute of Science e la Università di Princeton. Era un ricercatore senior nella divisione del premio Nobel Manfred Eigen presso l'Istituto Max Planck di chimica biofisica alla Germania.[1]
Fernandez è affiliato come Professore con più istituzioni, tra cui l'Istituto Max Planck di Biochimica, l'Università di Chicago, Osaka University, l'Indiana University School of Medicine, l'Istituto Morgridge per la ricerca, e la Nazionale Tsing-Hua Università. Fernandez ha tenuto la cattedra Karl F. Hasselmann di Bioingegneria presso la Rice University (Stati Uniti d'America).[4]
Fernandez a sviluppato il concetto di dehydron,[5] un difetto strutturale nella proteina che promuove la propria disidratazione.[6] Un dehydron è costituito da un legame di idrogeno intramolecolare che è "underwrapped" o non completamente schermato dall'attacco dall'acqua nella sfera di solvatazione.[7] Il dehydron causa "tensione epistructurale", vale a dire, tensione superficiale intorno alla struttura delle proteine[8], e quindi promuove le associazioni proteina-proteina e proteina-ligando.[9] Il dehydron ha implicazioni per la scoperta di farmaci, come dehydrons possono essere bersaglio di farmaci altamente specifici / ligandi progettati per migliorare dehydron avvolgere dal legame.[10] Quindi, dehydrons costituiscono filtri di selettività efficaci per la progettazione di farmaci, dando luogo alla cosiddetta "tecnologia di confezionamento", una piattaforma per progettare farmaci più sicuri.[11][12][13][14]
Fernandez ha pubblicato tre libri e più di 426 articoli scientifici.[15]
Fernandez è stato assegnato il distinto Camille e Henry Dreyfus Nuova Facoltà nel 1989[1]; la Camille e Henry Dreyfus Teacher-Scholar nel 1991[16]; Guggenheim Fellow nel 1995[17]; ed è un Fellow eletto della American Institute per la Ingegneria medica e biologica nel 2006[18].
Physics at the Biomolecular Interface, Ariel Fernández (ISBN 978-3319308517, Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg, 2016).
A Mathematical Approach to Protein Biophysics, L. Ridgway Scott, Ariel Fernandez (ISBN 978-3319660318, Springer, Berlin, Heidelberg, 2017).
Artificial Intelligence Platform for Molecular Targeted Therapy: A Translational Science Approach, Ariel Fernández (ISBN 978-9811232305, World Scientific Publishing Company, Singapore, 2021).
Topological Dynamics in Metamodel Discovery with Artificial Intelligence: From Biomedical to Cosmological Technologies, Ariel Fernández (ISBN 978-1032366326, Chapman & Hall/ CRC Press, UK, 2022).
Artificial Intelligence on Dark Matter and Dark Energy: Reverse Engineering of the Big Bang, Ariel Fernández (ISBN 978-1032465548, Chapman & Hall/ CRC Press, UK, 2023).
^Fernández A, Scott R. Dehydron: a structurally encoded signal for protein interaction. Biophys J. 2003 Sep;85(3):1914-28. PMID 12944304[2]
^Fernández A, Scott R. Adherence of packing defects in soluble proteins. Phys Rev Lett. 2003 91(1):018102. PMID 12906578[3]
^Koppes S. for University of Chicago News Office. Discovery of new sticky force that binds proteins could lead to better drug design. 2 July 2003 [4]
^Fernández A. Epistructural tension promotes protein associations. Phys Rev Lett. 2012 May 4;108(18):188102. PMID 22681121[5]
^Monroe D. Focus: Proteins Hook up Where Water Allows. Physics 2012 May 4; 5, 51 [6]
^Crunkhorn S. Anticancer drugs: Redesigning kinase inhibitors. February 2008. Nature Revs Drug Discovery 7:120-121 doi 10.1038/nrd2524 [7]
^Boyd J. for Rice University News and Media. Drug design: New book introduces fresh approach. 28 April 2010 [8]Archiviato il 1º settembre 2016 in Internet Archive.
^Demetri G. D. Structural reengineering of imatinib to decrease cardiac risk in cancer therapy.2007 Dec 3; J Clin Invest. 117(12):3650–3653. doi 10.1172/JCI34252 [9]
^Dunham W. Reworked Gleevec curbs heart-related complication. REUTERS December 3, 2007 [10]Archiviato il 16 gennaio 2016 in Archive.is.
^Wisconsin Alumni Research Foundation, Invention: Treating Heart Failure by Inhibiting Myosin Interaction with a Regulatory Myosin Binding Protein (US patent No. 9,051,387), Inventors: Richard L. Moss and Ariel Fernandez [11]Archiviato il 10 dicembre 2015 in Internet Archive.