Hromosom 3 | |
---|---|
![]() | |
![]() Kariogram para hromosoma 3 kod muškarca | |
Karakteristike | |
Dužina (bp) | 198,295,559 bp (GRCh38)[1] |
Br. gena | 1.024 (CCDS)[2] |
Vrsta | Autosom |
Pozicija centromere | Metacentrik[3] (90.9 Mbp[4]) |
Kompletan spisak gena | |
CCDS | Spisak gena |
HGNC | Spisak gena |
UniProt | Spisak gena |
NCBI | Spisak gena |
Vanjski preglednici karata | |
Ensembl | Hromosom 3 |
Entrez | Hromosom 3 |
NCBI | Hromosom 3 |
UCSC | Hromosom 3 |
Potpune DNK sekvence | |
RefSeq | NC_000003 (FASTA) |
GenBank | CM000665 (FASTA) |
Hromosom 3 je jedan od 23 para hromosoma u hromosomskoj garnituri čovjeka (2n = 46). Ljudi normalno imaju dvije kopije ovoga hromosoma. Hromosom 3 sadrži oko 200 miliona baznih parova (bp), a njegov gradivni materijal predstavlja oko 6,5% ukupne DNK u ćeliji.
Identifikacija gena na svakom hromosomu je veoma aktivno područje genetičkih istraživanja. Pošto istraživači primijenjuju različite pristupe za predikciju broja gena na svakom hromosomu, procjena broja pripadajućih gena varira. Hromosom 3 vjerovatno sadrži između 1.100 and 1.500 gena.
Slijede neke od procjena broja gena za ljudski hromosom 3. Budući da istraživači koriste različite pristupe anotacija genoma, njihova predviđanja broja gena na svakom od njih variraju (za tehničke detalje pogledajte predviđanje gena). Među raznim projektima, zajednički projekat konsenzusnog kodiranja (Projekt konsenzusnog označavanje sekvenci) (CCDS) zauzima izuzetno konzervativnu strategiju. Dakle, predviđanje broja gena prema CCDS-u predstavlja donju granicu ukupnog broja gena koji kodiraju ljudske proteine.[5]
Baza podataka | Protein-kodirajući geni | Geni nekodirajuće RNK | Pseudogeni | Izvor | Datum objave |
---|---|---|---|---|---|
CCDS | 1.024 | — | — | [2] | 2016-09-08 |
HGNC | 1.036 | 483 | 761 | [6] | 2017-05-12 |
Ensembl | 1.073 | 1.158 | 761 | [7] | 2017-03-29 |
UniProt | 1,081 | — | — | [8] | 2018-02-28 |
NCBI | 1.085 | 1.108 | 902 | [9][10][11] | 2017-05-19 |
Slijedi djelimična lista gena na ljudskom hromosomu 3. Potpunu listu pogledajte u informacijskom okviru s desne strane.
Djelimična lista gena smještenih na (kratkom) p-kraku ljudskog hromosoma 3:
Djelimična lista gena smještenih na (dugo) q-kraku ljudskog hromozoma 3:
Sljedeće bolesti i poremećaji su neki od onih koji se odnose na gene na ljudskom hromosomu 3:
Lokacije na ljudskom hromozomu 3 povezanae su sa respiratornom insuficijencijom i vjerovatno sa povećanom ozbiljnošću u COVID-19[12][13]
Hromosom | Krak – p: krtatki, q: dugi | Pruga | ISCN Start[18] |
ISCN stop[18] |
Bazni par Start |
Bazn par Stop |
Gustoća | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
3 | p | 26.3 | 0 | 175 | 1 | 2.800.000 | gpos | 50 |
3 | p | 26.2 | 175 | 263 | 2.800.001 | 4.000.000 | gneg | |
3 | p | 26.1 | 263 | 408 | 4.000.001 | 8.100.000 | gpos | 50 |
3 | p | 25.3 | 408 | 642 | 8.100.001 | 11.600.000 | gneg | |
3 | p | 25.2 | 642 | 759 | 11.600.001 | 13.200.000 | gpos | 25 |
3 | p | 25.1 | 759 | 963 | 13.200.001 | 16.300.000 | gneg | |
3 | p | 24.3 | 963 | 1269 | 16.300.001 | 23.800.000 | gpos | 100 |
3 | p | 24.2 | 1269 | 1357 | 23.800.001 | 26.300.000 | gneg | |
3 | p | 24.1 | 1357 | 1561 | 26.300.001 | 30.800.000 | gpos | 75 |
3 | p | 23 | 1561 | 1751 | 30.800.001 | 32.000.000 | gneg | |
3 | p | 22.3 | 1751 | 1926 | 32.000.001 | 36.400.000 | gpos | 50 |
3 | p | 22.2 | 1926 | 2013 | 36.400.001 | 39.300.000 | gneg | |
3 | p | 22.1 | 2013 | 2188 | 39.300.001 | 43.600.000 | gpos | 75 |
3 | p | 21.33 | 2188 | 2451 | 43.600.001 | 44.100.000 | gneg | |
3 | p | 21.32 | 2451 | 2626 | 44.100.001 | 44.200.000 | gpos | 50 |
3 | p | 21.31 | 2626 | 3239 | 44.200.001 | 50.600.000 | gneg | |
3 | p | 21.2 | 3239 | 3385 | 50.600.001 | 52.300.000 | gpos | 25 |
3 | p | 21.1 | 3385 | 3676 | 52.300.001 | 54.400.000 | gneg | |
3 | p | 14.3 | 3676 | 3910 | 54.400.001 | 58.600.000 | gpos | 50 |
3 | p | 14.2 | 3910 | 4143 | 58.600.001 | 63.800.000 | gneg | |
3 | p | 14.1 | 4143 | 4362 | 63.800.001 | 69.700.000 | gpos | 50 |
3 | p | 13 | 4362 | 4566 | 69.700.001 | 74.100.000 | gneg | |
3 | p | 12.3 | 4566 | 4814 | 74.100.001 | 79.800.000 | gpos | 75 |
3 | p | 12.2 | 4814 | 4946 | 79.800.001 | 83.500.000 | gneg | |
3 | p | 12.1 | 4946 | 5077 | 83.500.001 | 87.100.000 | gpos | 75 |
3 | p | 11.2 | 5077 | 5135 | 87.100.001 | 87.800.000 | gneg | |
3 | p | 11.1 | 5135 | 5266 | 87.800.001 | 90.900.000 | acen | |
3 | q | 11.1 | 5266 | 5427 | 90.900.001 | 94.000.000 | acen | |
3 | q | 11.2 | 5427 | 5602 | 94.000.001 | 98.600.000 | gvar | |
3 | q | 12.1 | 5602 | 5762 | 98.600.001 | 100.300.000 | gneg | |
3 | q | 12.2 | 5762 | 5850 | 100.300.001 | 101.200.000 | gpos | 25 |
3 | q | 12.3 | 5850 | 5996 | 101.200.001 | 103.100.000 | gneg | |
3 | q | 13.11 | 5996 | 6229 | 103.100.001 | 106.500.000 | gpos | 75 |
3 | q | 13.12 | 6229 | 6361 | 106.500.001 | 108.200.000 | gneg | |
3 | q | 13.13 | 6361 | 6594 | 108.200.001 | 111.600.000 | gpos | 50 |
3 | q | 13.2 | 6594 | 6682 | 111.600.001 | 113.700.000 | gneg | |
3 | q | 13.31 | 6682 | 6871 | 113.700.001 | 117.600.000 | gpos | 75 |
3 | q | 13.32 | 6871 | 6973 | 117.600.001 | 119.300.000 | gneg | |
3 | q | 13.33 | 6973 | 7148 | 119.300.001 | 122.200.000 | gpos | 75 |
3 | q | 21.1 | 7148 | 7294 | 122.200.001 | 124.100.000 | gneg | |
3 | q | 21.2 | 7294 | 7440 | 124.100.001 | 126.100.000 | gpos | 25 |
3 | q | 21.3 | 7440 | 7674 | 126.100.001 | 129.500.000 | gneg | |
3 | q | 22.1 | 7674 | 7936 | 129.500.001 | 134.000.000 | gpos | 25 |
3 | q | 22.2 | 7936 | 8053 | 134.000.001 | 136.000.000 | gneg | |
3 | q | 22.3 | 8053 | 8228 | 136.000.001 | 139.000.000 | gpos | 25 |
3 | q | 23 | 8228 | 8461 | 139.000.001 | 143.100.000 | gneg | |
3 | q | 24 | 8461 | 8811 | 143.100.001 | 149.200.000 | gpos | 100 |
3 | q | 25.1 | 8811 | 9001 | 149.200.001 | 152.300.000 | gneg | |
3 | q | 25.2 | 9001 | 9162 | 152.300.001 | 155.300.000 | gpos | 50 |
3 | q | 25.31 | 9162 | 9264 | 155.300.001 | 157.300.000 | gneg | |
3 | q | 25.32 | 9264 | 9366 | 157.300.001 | 159.300.000 | gpos | 50 |
3 | q | 25.33 | 9366 | 9453 | 159.300.001 | 161.000.000 | gneg | |
3 | q | 26.1 | 9453 | 9803 | 161.000.001 | 167.900.000 | gpos | 100 |
3 | q | 26.2 | 9803 | 9949 | 167.900.001 | 171.200.000 | gneg | |
3 | q | 26.31 | 9949 | 10183 | 171.200.001 | 176.000.000 | gpos | 75 |
3 | q | 26.32 | 10183 | 10329 | 176.000.001 | 179.300.000 | gneg | |
3 | q | 26.33 | 10329 | 10489 | 179.300.001 | 183.000.000 | gpos | 75 |
3 | q | 27.1 | 10489 | 10620 | 183.000.001 | 184.800.000 | gneg | |
3 | q | 27.2 | 10620 | 10737 | 184.800.001 | 186.300.000 | gpos | 25 |
3 | q | 27.3 | 10737 | 10883 | 186.300.001 | 188.200.000 | gneg | |
3 | q | 28 | 10883 | 11175 | 188.200.001 | 192.600.000 | gpos | 75 |
3 | q | 29 | 11175 | 11700 | 192.600.001 | 198.295.559 | gneg |
<ref>
; naziv "850bphs" definiran je nekoliko puta s različitim sadržajem
![]() |
Commons ima datoteke na temu: Hromosom 3 |