Jedarcetov protein 56 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NOP56.[5][6]
Nop56p je kvaščev nukleolusni protein koji je dio kompleksa sa jedarcetovim proteinima Nop58p i fibrilarin. Nop56p je potreban za sastavljanje 60S ribosomske podjedinice i uključen je u preribosomsku preradu RNK. Protein koji je kodiran ovim genom dio je sekvence Nop56p, a nalazi se i u nukleolusu. Za ovaj gen pronađeno je više varijanti transkripta koji kodiraju nekoliko različitih izoformi, ali priroda većine njih u punoj dužini nije utvrđena.[6] NOP56 je komponenta C / D malih nukleolusnih ribonukleoproteinskih kompleksa koji usmjeravaju 2-prim-O-metilaciju pre-ribosomske RNK (rRNK) tokom njenog sazrijevanja. Predviđa se da NOP56 funkcionira u ranom do srednjem koraku u prerade pre-rRNK.
Pretragom u ljudskoj EST bazi podataka za sekvence slične kvaščevoj Nop56, nakon čega slijedi pregled HeDa ćelijske cDNK biblioteke, Gautier et al. (1997) klonirali su NOP56. Izvedeni protein s 602 aminokiseline je 52% identičan kvaščevom Nop56.
Koristeći RT-PCR, Kobayashi et al.. (2011) otkrili su varijabilnu ekspresiju Nop56 u svim ispitivanim tkivima miša, s najvećom ekspresijom u slezeni, cijelom mozgu, cerebralnoj kori i malom mozgu, a najmanjom u kičmenoj moždini, srcu i plućima. Imunohistohemijska analiza mozga odraslih otkrila je Nop56 u Purkinjeovim ćelijama malog mozga, motornim neuronima podjezičnog jezgra i prednjem rogu kičmene moždine. Western blot analizom otkriven je Nop56 pri prividnoj molekulskoj masi od 66 kD i u jedarnoj i u citoplazmatskoj frakciji malog i malog mozga miša.
Gautier et al. (1997) otkrili su da smrtonosna mutacija Nop56 osjetljiva na temperaturu inhibira mnoge korake u obradi pre-rRNK i dovodi do oštećenja u sklopu podjedinice 60S. Ekspresija ljudskog NOP56 nije upotpunila nultu mutaciju Nop56.
Upotrebom ljudskog NOP56 označenog epitopom, Hayano et al. (2003) su pročišćene komplekse povezali sa NOP56 iz ćelija ljudskog bubrega 293EBNA. Maseno-spektrometrijske analize otkrile su 62 ribosomskih proteina, 45 neribosomskih proteina te i pre-rRNK i zrele tipove rRNK, što sugerira da je NOP56 uključen u prereradu rRNK. Treacle (TCOF1; 606847) bio je među proteinima povezanim s NOP56, a njegovA povezanost s NOP56 ostala je i nakon tretmana RNaZOM. Eksperimenti s povlačenjem proteina potvrdili su izravnu interakciju između NOP56 i patuljastosti.
Analizom genomske veze, praćenom sekvenciranjem gena kandidata i ponovljenom analizom pet japanskih porodica sa spinocerebelarnom ataksijom-36 (SCA36; 614153), Kobayashi et al. (2011) identificirali su patogenu heterozigotnu 6-bp ponovljenu ekspanziju (GGCCTG; rs68063608) u intronu 1 gena NOP56 (614154.0001). Identificirana su i četiri dodatna pacijenta sa SCA koji nose ovo ponavljanje ekspanzije. Ukupno je pronađeno 9 (3,6%) nepovezanih slučajeva među 251 pacijentom iz posmatrane kohorte. Fluorescentna hibridizacija in situ pacijentskih limfoblastoidnih ćelija pokazala je žarišta RNK, koja nisu pronađena u kontrolnim ćelijama, a dvostruki testovi bojenja i pomjeranja gela pokazali su da se prošireni ponovljeni GGCCUG vezao i sekvestrirao RNK-vezujući protein SFRS2 (600813), dok (CUG ) (6) nije. Pored toga, transkripcija MIR1292 značajno je smanjena u limfoblastoidnim ćelijama SCA pacijenata. Nalazi su ukazali da je SCA36 uzrokovan ponovljenim širenjem heksanukleotida kroz toksični dobitak funkcije. Fenotip je karakterizirala cerebelarna ataksija kod odraslih, s razvojem bolesti motornih neurona koja je uglavnom uticala na proksimalne mišiće nakon dugog trajanja bolesti.[7][8][9][10]
1020304050 MVLLHVLFEHAVGYALLALKEVEEISLLQPQVEESVLNLGKFHSIVRLVA FCPFASSQVALENANAVSEGVVHEDLRLLLETHLPSKKKKVLLGVGDPKI GAAIQEELGYNCQTGGVIAEILRGVRLHFHNLVKGLTDLSACKAQLGLGH SYSRAKVKFNVNRVDNMIIQSISLLDQLDKDINTFSMRVREWYGYHFPEL VKIINDNATYCRLAQFIGNRRELNEDKLEKLEELTMDGAKAKAILDASRS SMGMDISAIDLINIESFSSRVVSLSEYRQSLHTYLRSKMSQVAPSLSALI GEAVGARLIAHAGSLTNLAKYPASTVQILGAEKALFRALKTRGNTPKYGL IFHSTFIGRAAAKNKGRISRYLANKCSIASRIDCFSEVPTSVFGEKLREQ VEERLSFYETGEIPRKNLDVMKEAMVQAEEAAAEITRKLEKQEKKRLKKE KKRLAALALASSENSSSTPEECEEMSEKPKKKKKQKPQEVPQENGMEDPS ISFSKPKKKKSFSKEELMSSDLEETAGSTSIPKRKKSTPKEETVNDPEEA GHRSGSKKKRKFSKEEPVSSGPEEAVGKSSSKKKKKFHKASQED