Proteom je soubor proteinů, které jsou produkované z genomu daného organismu. Pojem proteom byl poprvé použit Marcem Wilkinsem [1] v roce 1995.
Proteom můžeme šířeji chápat buď jako buněčný, nebo jako kompletní:
Proteom je početnější než genom, zejména u eukaryot. Je to hlavně díky alternativnímu splicingu RNA a posttranslačním modifikacím proteinů, jako fosforylace nebo štěpení peptidového řetězce.