Název dostala koncem 50. let 20. století. Odlišnost vlajek, praporů a erbů, si však údajně mnozí badatelé uvědomovali již ve dvacátých a třicátých letech 20. století a napsali o nich hodně podnětných publikací. Mnohé údaje v nich obsažené byly upřesňovány, řada domněnek však stále platí. Název vědy vznikl z latinského slova vexillum jako zdrobnělina od slova velum (plachta), a to k označení kusu látky upevněné na krátké tyči a zavěšené na žerdi za speciálním účelem, tedy vlajky.[1]
Slovo vexilologie poprvé použil dr. Whitney Smith v říjnu 1958 ve svém článku Flags of the Arab World. V Československu se termín vexillologie (tehdy ještě se dvěma l) objevil ve studii, kterou napsal Ing. Josef Česák a publikoval ji v knize Josefa Pavla Kroumana Sbíráme odznaky (Praha, 1969).[2]
V České republice působí Česká vexilologická společnost, která vznikla v roce 1972 a od roku 1993 je členem FIAV (Fédération Internationale des Associations Vexillologiques). Společnost od svého vzniku vydává čtvrtletní zpravodaj Vexilologie (ISSN1211-2615). Dále v Česku působí například World Vexillological Research Institute založený v roce 1992, člen FIAV od roku 1993. WVRI vydává čtvrtletník Flaggen, Wappen und Siegel (ISSN 0948-3748) informující o vlajkách, znacích a pečetích.
Světový vexilologický den, v Česku nazývaný i Světový den vlajek (anglickyWorld Vexillology Day) nebo zkráceně Vexiday, který byl stanoven na 1. října, je věnován vlajkám a jejich studiu (vexilologii). Datum bylo stanoveno podle data v roce 1961, kdy vyšlo první číslo The Flag Bulletinu – prvního odborného časopisu věnovaného vlajkám.
