Aart Vierhouten passe professionnel en 1996 dans l'équipe Rabobank. En 2002, il rejoint l'équipe belgeLotto, dans laquelle il lance les sprints pour Robbie McEwen. En 2008, il est membre de l'équipe P3 Transfer-Batavus où il met son expérience au service de jeunes coureurs, jusqu'en 2009. Il prend sa retraite à l'issue de cette dernière saison.