Citrobacter est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Enterobacteriaceae. Son nom, formé du latin citrus (citron) et du néolatin bacter (bacille), fait référence à la capacité de l'espèce type à utiliser le citrate[1].
Plusieurs espèces, notamment l'espèce type Citrobacter freundii, sont des pathogènes humains occasionnels.
Le genre Citrobacter est créé en 1932 par reclassement d'une espèce alors nommée « Bacterium freundii »[1].
Jusqu'en 2016 il était rattaché par des critères phénotypiques à la famille des Enterobacteriaceae. Malgré la refonte de l'ordre des Enterobacterales par Adeolu et al. en 2016 à l'aide des techniques de phylogénétique moléculaire, Citrobacter reste dans la famille des Enterobacteriaceae dont le périmètre redéfini compte néanmoins beaucoup moins de genres qu'auparavant[2].
Selon la LPSN (29 octobre 2022)[3] :
- Citrobacter amalonaticus (Young et al. 1971) Brenner & Farmer 1982
- Citrobacter braakii Brenner et al. 1993
- Citrobacter cronae Oberhettinger et al. 2020
- Citrobacter europaeus Ribeiro et al. 2017
- Citrobacter farmeri Brenner et al. 1993
- Citrobacter freundii (Braak 1928) Werkman & Gillen 1932 – espèce type
- Citrobacter gillenii Brenner et al. 2000
- Citrobacter koseri Frederiksen 1970
- Citrobacter murliniae Brenner et al. 2000
- Citrobacter pasteurii Clermont et al. 2015
- Citrobacter portucalensis Ribeiro et al. 2017
- Citrobacter rodentium Schauer et al. 1996
- Citrobacter sedlakii Brenner et al. 1993
- Citrobacter telavivensis corrig. Ribeiro et al. 2021
- Citrobacter werkmanii Brenner et al. 1993
- Citrobacter youngae Brenner et al. 1993
Au sein du genre, l'espèce C. diversus a été reclassée en Citrobacter koseri.
- ↑ a et b Werkman CH & Gillen GF « Bacteria producing trimethylene glycol » J Bacteriol. 1932;23(2):167-182. Accès libre.
- ↑ Adeolu M et al. « Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov. » Int J Syst Evol Microbiol. 2016;66(12):5575-5599. Accès libre.
- ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 29 octobre 2022