, Saccharibacter , Saccharobacter , Saccharococcus , Saccharomonospora
Bacteria → Proteobacteria → Gammaproteobacteria → Alteromonadales → Alteromonadaceae , Saccharopolyspora , Saccharospirillaceae , Saccharospirillum , Saccharothrix , Sagittula , Salana , Salegentibacter , Salicola , Salinibacillus , Salinibacter , Salinibacterium , Salinicoccus , Salinimonas , Salinisphaera , Salinisphaeraceae , Salinisphaerales , Salinispora
Bacteria → Proteobacteria → Gammaproteobacteria → Vibrionales → Vibrionaceae , Salipiger , Salmonella , Samsonia , Sandaracinobacter , Sandarakinorhabdus , Sandarakinotalea , Sanguibacter , Sanguibacteraceae , Saprospira , Saprospiraceae , Sarcina
, Scardovia , Schineria , Schlegelella , Schwartzia
, Sebaldella , Sedimentibacter , Sediminicola , Segniliparaceae , Segniliparus , Seinonella , Sejongia , Selenihalanaerobacter , Selenomonas , Seliberia , Serinicoccus , Serpens , Serpulina , Serpulinaceae , Serratia
, Shewanella , Shewanellaceae , Shigella , Shimia , Shinella , Shuttleworthia
, Silanimonas , Silicibacter , Silvimonas , Simkania , Simkaniaceae , Simonsiella , Simplicispira , Sinococcus , Sinorhizobium
, Skermanella , Skermania
Bacteria → Actinobacteria → Coriobacteriales → Coriobacteriaceae
, Smithella
Bacteria → Fusobacteria → Fusobacteria → Fusobacteriales → Leptotrichiaceae
Bacteria → Cyanobacteria → Cyanophyceae → Synechococcales → Merismopediaceae → Gomphosphaerioideae
, Sodalis , Soehngenia , Solirubrobacter , Solobacterium , Sorangium
, Sphaerobacter , Sphaerobacteraceae , Sphaerobacterales , Sphaerotilus , Sphingobacteria , Sphingobacteriaceae , Sphingobacteriales , Sphingobacterium , Sphingobium , Sphingomonadaceae , Sphingomonadales , Sphingomonas , Sphingopyxis , Sphingosinicella , Spirillaceae , Spirilliplanes , Spirillospora , Spirillum , Spirochaeta , Spirochaetaceae , Spirochaetales , Spirochaetes , Spirochaetes , Spiroplasma , Spiroplasmataceae , Spirosoma , Sporacetigenium , Sporanaerobacter , Sporichthya , Sporichthyaceae , Sporobacter , Sporobacterium , Sporocytophaga , Sporohalobacter , Sporolactobacillaceae , Sporolactobacillus , Sporomusa , Sporosarcina , Sporotomaculum
, Stackebrandtia , Staleya , Stanierella , Staphylococcaceae , Staphylococcus , Stappia , Starkeya , Stella , Stenothermobacter , Stenotrophomonas , Sterolibacterium , Stigmatella , Streptacidiphilus , Streptoalloteichus , Streptobacillus , Streptococcaceae , Streptococcus , Streptomonospora , Streptomyces , Streptomycetaceae , Streptosporangiaceae , Streptosporangium , Streptoverticillium
, Subdoligranulum , Subsaxibacter , Subsaximicrobium , Subtercola , Succiniclasticum , Succinimonas , Succinispira , Succinivibrio , Succinivibrionaceae , Sulfitobacter , Sulfobacillus , Sulfuricurvum , Sulfurihydrogenibium , Sulfurimonas , Sulfurivirga , Sulfurospirillum , Sulfurovum , Sutterella , Suttonella
, Swaminathania
, Symbiobacterium , Symbiotes
Bacteria → Cyanobacteria → Cyanophyceae → Nostocales , Synergistes , Syntrophaceae , Syntrophobacter , Syntrophobacteraceae , Syntrophobacterales , Syntrophobotulus , Syntrophococcus , Syntrophomonadaceae , Syntrophomonas , Syntrophospora , Syntrophothermus , Syntrophus