, Rabenhorstia , Racemosporium , Rachicladosporium , Rachidicola , Raciborskiomyces , Racocetra , Racodium , Racoleus , Racovitziella , Radiatispora , Radiciseta , Radiigera , Radiomyces , Radiomycetaceae , Radotinea , Radulidium , Radulochaete , Radulodon , Radulodontia , Radulomyces , Radulomycetopsis , Radulum , Raffaelea , Ragnhildiana , Raizadenia , Ramakrishnanella , Ramakrishnania , Ramalia , Ramalina , Ramalinaceae , Ramaraomyces , Ramaria , Ramaricium , Ramariopsis , Ramboldia , Ramgea , Ramicandelaber , Ramicephala , Ramichloridium , Ramoconidiifera , Ramonia , Ramophialophora , Ramsbottomia , Ramularia , Ramulariopsis , Ramulaspera , Ramulispora , Ranojevicia , Rasamsonia , Rasutoria , Rattania , Ravenelia , Raveneliaceae
Fungi → Ascomycota → Dothideomycetes → Capnodiales → Teratosphaeriaceae , Rebentischia , Rechingeriella , Reconditella , Rectipilus , Recurvomyces , Redaellia , Redbia , Reddellomyces , Redeckera , Redheadia , Redingeria , Refractohilum , Regiocrella , Rehmiella , Rehmiellopsis , Rehmiodothis , Rehmiomycella , Reichlingia , Relicina , Relicinopsis , Remersonia , Remispora , Remleria , Remototrachyna , Renatobasidium , Renispora , Repetobasidiaceae , Repetobasidiellum , Repetobasidiopsis , Repetobasidium , Repetoblastiella , Repetophragma , Resendea , Resinicium , Resinomycena , Restilago , Restiosporium , Resupinatus , Retiarius , Retiboletus , Reticulascaceae , Reticulascus , Reticulocephalis , Reticulosphaeria , Retroa , Retroconis , Retrostium , Reyesiella
, Rhabdoclema , Rhabdocline , Rhabdogloeum , Rhabdomyces , Rhabdospora , Rhabdostromella , Rhabdostromina , Rhabdothyrium , Rhachomyces , Rhacodiella , Rhadinomyces , Rhagadolobium , Rhagadostoma , Rhagadostomella , Rhamphoria , Rhamphosphaeria , Rhamphospora , Rhamphosporaceae , Rhaphidicyrtis , Rheophila , Rhexoacrodictys , Rhexoampullifera , Rhexocercosporidium , Rhexodenticula , Rhexographium , Rhexoprolifer , Rhexosporium , Rhexothecium , Rhinocephalum , Rhinocladiella , Rhinocladium , Rhinotrichella , Rhinotrichum , Rhipidiomyces , Rhipidocarpon , Rhipidocephalum , Rhizidiocystis
Fungi → Myxomycota → Phycomycota → Hyphochytriales → Rhizidiomycetaceae
Fungi → Myxomycota → Phycomycota → Hyphochytriales , Rhizidium , Rhizina , Rhizinaceae , Rhizoblepharia , Rhizocalyx , Rhizocarpaceae , Rhizocarpon , Rhizochaete , Rhizocladosporium , Rhizoclosmatium , Rhizoctonia , Rhizodermea , Rhizodiscina , Rhizogene , Rhizomarasmius , Rhizomucor , Rhizomyces , Rhizophagus , Rhizophila , Rhizophlyctidaceae , Rhizophlyctidales , Rhizophlyctis , Rhizophydiaceae , Rhizophydiales , Rhizophydium , Rhizoplaca , Rhizopodaceae , Rhizopodomyces , Rhizopodopsis , Rhizopogon , Rhizopogonaceae , Rhizopogoniella , Rhizopus , Rhizopycnis , Rhizoscyphus , Rhizosiphon , Rhizosphaera , Rhizosphaerina , Rhizostilbella , Rhizotexis , Rhizothyrium , Rhodactina , Rhodesia , Rhodesiopsis , Rhodoarrhenia , Rhodobolites , Rhodocollybia , Rhodocybe , Rhodocyphella , Rhodogaster , Rhodonia , Rhodopaxillus , Rhodopeziza , Rhodophyllus , Rhodoscypha , Rhodosporidium , Rhodosticta , Rhodotarzetta , Rhodothallus , Rhodothrix , Rhodotorula , Rhodotus , Rhodoveronaea , Rhombostilbella , Rhopalocladium , Rhopalogaster , Rhopalomyces , Rhopalophlyctis , Rhopalostroma , Rhopographella , Rhopographina , Rhopographus , Rhymbocarpus , Rhynchodiplodia , Rhynchogastrema , Rhynchogastremataceae , Rhynchomelas , Rhynchomeliola , Rhynchomyces , Rhynchonectria , Rhynchophoma , Rhynchophoromyces , Rhynchoseptoria , Rhynchosphaeria , Rhynchosporina , Rhynchosporium , Rhynchostoma , Rhynchostomataceae , Rhytidenglerula , Rhytidhysteron , Rhytidiella , Rhytidopeziza , Rhytidospora , Rhytisma , Rhytismataceae , Rhytismatales
, Ribaldia , Richonia , Richoniella , Rickenella , Rickenellaceae , Rickia , Rickiella , Riclaretia , Riedera , Riessia , Riessiella , Rigidoporopsis , Rigidoporus , Rileya , Rimaconus , Rimbachia , Rimelia , Rimora , Rimula , Rimularia , Rinodina , Rinodinella , Riomyces , Ripartitella , Ripartites , Ripexicium , Rivilata , Rivulicola , Rizalia , Rizaliopsis
Fungi → Ascomycota , Robillarda , Robincola , Robledia , Roburnia , Roccella , Roccellaceae , Roccellina , Roccellinastrum , Roccellographa , Rodaucea , Rodwaya , Rodwayella , Roesleria , Roeslerina , Roestelia , Rogergoosiella , Rogersella , Rogersiomyces , Rogersonia
Fungi → Ascomycota , Rolfidium , Rollandina , Rolueckia , Romanoa , Romellia , Romellina , Romjularia , Ronnigeria , Ropalospora , Ropalosporaceae
Fungi → Basidiomycota → Agaricomycetes → Agaricales → Mycenaceae , Rosasphaeria , Roscoepoundia , Rosellinia , Roselliniella , Roselliniomyces , Roselliniopsis , Rosellinula , Rosenscheldia , Rosenscheldiella , Roseodiscus , Roseofavolus , Roseograndinia , Rossbeevera , Rossiomyces , Rossmania , Rostraureum , Rostrocoronophora , Rostrohypoxylon , Rostronitschkia , Rostrosphaeria , Rostrupia , Rostrupiella , Rosulomyces , Rota , Rotaea
Fungi → Ascomycota → Sordariomycetes → Hypocreales → Cordycipitaceae , Roumegueria , Roumegueriella , Roussoella , Roussoellaceae , Roussoellopsis , Royoporus , Royoungia , Rozites
, Rubikia , Rubinoboletus , Rubrinectria , Rubroporus , Rubrotricha , Ruggieria , Rugonectria , Rugosomyces , Rugosospora , Ruhlandiella , Ruptoseptoria , Russula , Russulaceae , Russulales , Russulina , Rutola , Rutstroemia , Rutstroemiaceae
Fungi → Ascomycota → Sordariomycetes → Xylariales → Xylariaceae
Fungi → Ascomycota → Sordariomycetes → Sordariales → Lasiosphaeriaceae
, Ryparobius , Ryvardenia