Nel 1689 sposò Francis Godolphin, II conte di Godolphin, figlio dello statista Sidney Godolphin, I conte di Godolphin, amico e alleato politico dei genitori. Divenne, nel 1706, Viscontessa Rialton quando il suocero venne creato Conte di Godolphin, e divenne Contessa di Godolphin nel 1712, quando il marito divenne II Conte di Godolphin. Suo padre morì senza eredi maschi, cosicché Henrietta divenne Duchessa di Marlborough nel 1722, grazie a un atto del Parlamento inglese che permise alle figlie del primo Duca di ereditare i suoi titoli inglesi.
Morte
Henrietta Churchill-Goldphin ritratta da Charles Jervas
Dal matrimonio tra Henrietta e Francis Godolphin, II conte di Godolphin nacquero cinque figli:
William Godolphin, marchese di Blandford (1700-1731), si sposò con Maria de Jong ma non ebbe discendenza. Fu questo il motivo per il quale i titoli e i beni dei Marlborough passeranno poi agli Spencer, discendenti della sorella minore di Henrietta, Anne;
Mary Godolphin (1705-3 agosto 1764)[2], sposò Thomas Osborne, IV duca di Leeds, ebbero un figlio. Di quest'ultima si disse sempre che fosse in realtà figlia del drammaturgo William Cogreve, del quale Henrietta fu mecenate e a lungo amante. Nonostante ciò Francis Godolphin la crebbe come una propria figlia, anche se la nonna materna, Sarah, non la riconobbe come propria nipote fino al 1740, quando le due si riconciliarono.
