Viroidi della familia Pospiviroidae. I pospiviroidae sono una famiglia di viroidi , compreso il primo viroide scoperto, PSTVd.
La loro struttura secondaria è la chiave della loro attività biologica.[1]
La classificazione di questa famiglia si basa sulle differenze nella sequenza conservata della regione centrale. Il genoma è costituito (in questo ordine) da un dominio terminale LH, un dominio patogeno, una regione centrale conservata (anello staminale pospiviroide RY motif), dominio variabile e un dominio terminale RH.[2]
La replicazione di Pospiviroidae avviene in modo asimmetrico tramite RNA polimerasi , RNasi e RNA ligasi delle cellule ospiti. Il materiale genetico del viroide "confonde" i meccanismi di replicazione della cellula infettata, presentando similitudine molecolare con gli introni di peso compreso 5,8S e 25S dell'RNAs ribosomiale.[3]
Famiglia Pospiviroidae:[4]
Genere Pospiviroid ; specie tipo : Potato spindle tuber viroid
Genere Hostuviroid ; specie tipo: Hop stunt viroid
Genere Cocadviroid ; specie tipo: Coconut cadang-cadang viroid
Genere Apscaviroid ; specie tipo: Apple scar skin viroid
Genere coleviroide ; specie tipo: Coleus blumei viroid 1
^ Flores R, Navarro B, Delgado S, Serra P, Di Serio F, Viroid pathogenesis: a critical appraisal of the role of RNA silencing in triggering the initial molecular lesion , in FEMS Microbiol. Rev. , May 2020, DOI :10.1093/femsre/fuaa011 , PMID 32379313 . URL consultato il 25 giugno 2020 .
^ Giguère T, Perreault JP, Classification of the Pospiviroidae based on their structural hallmarks , in PLoS ONE , vol. 12, n. 8, 2017, pp. e0182536, DOI :10.1371/journal.pone.0182536 , PMC 5544226 , PMID 28783761 . URL consultato il 25 giugno 2020 .
^ Alan Cann, Principles of Molecular Virology , Elsevier, 9 agosto 2005, pp. 251–, ISBN 978-0-12-088789-7 .
^ (EN ) Pospiviroidae - Subviral Agents - Subviral Agents (2011) - , su talk.ictvonline.org , International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). URL consultato il 25 giugno 2020 (archiviato dall'url originale il 1º luglio 2019) .
Giguère T, Perreault JP, Classification of the Pospiviroidae based on their structural hallmarks , in PLoS ONE , vol. 12, n. 8, 2017, pp. e0182536, DOI :10.1371/journal.pone.0182536 , PMC 5544226 , PMID 28783761 . URL consultato il 25 giugno 2020 .
Matsushita Y, Yanagisawa H, Sano T, Vertical and Horizontal Transmission of Pospiviroids , in Viruses , vol. 10, n. 12, December 2018, DOI :10.3390/v10120706 , PMC 6315636 , PMID 30545048 . URL consultato il 25 giugno 2020 .
Giguère T, Perreault JP, Classification of the Pospiviroidae based on their structural hallmarks , in PLoS ONE , vol. 12, n. 8, 2017, pp. e0182536, DOI :10.1371/journal.pone.0182536 , PMC 5544226 , PMID 28783761 . URL consultato il 25 giugno 2020 .
Giguère T, Adkar-Purushothama CR, Perreault JP, Comprehensive secondary structure elucidation of four genera of the family Pospiviroidae , in PLoS ONE , vol. 9, n. 6, 2014, pp. e98655, DOI :10.1371/journal.pone.0098655 , PMC 4045682 , PMID 24897295 . URL consultato il 25 giugno 2020 .
Flores R, Hernández C, Martínez de Alba AE, Daròs JA, Di Serio F, Viroids and viroid-host interactions , in Annu Rev Phytopathol , vol. 43, 2005, pp. 117–39, DOI :10.1146/annurev.phyto.43.040204.140243 , PMID 16078879 . URL consultato il 25 giugno 2020 . * Freidhoff P, Bruist MF, In silico survey of the central conserved regions in viroids of the Pospiviroidae family for conserved asymmetric loop structures , in RNA , vol. 25, n. 8, August 2019, pp. 985–1003, DOI :10.1261/rna.070409.119 , PMID 31123078 . URL consultato il 25 giugno 2020 . Ahmed Hadidi, Ricardo Flores, John W Randles, Peter Palukaitis, Viroids and Satellites , Elsevier Science, 18 luglio 2017, pp. 480–, ISBN 978-0-12-801702-9 .
T.O. Diener, The Viroids , Springer Science & Business Media, 6 dicembre 2012, pp. 342–, ISBN 978-1-4613-1855-2 .
Richard Ellis Ford Matthews e Roger Hull, Matthews' Plant Virology , Gulf Professional Publishing, 2002, pp. 593–, ISBN 978-0-12-361160-4 .
L. R. Verma e R. C. Sharma, Diseases of Horticultural Crops: Fruits , Indus Publishing, 1999, pp. 563–, ISBN 978-81-7387-095-8 .
Alan Cann, Principles of Molecular Virology , Elsevier, 9 agosto 2005, pp. 251–, ISBN 978-0-12-088789-7 .