Oltre che con numerose nazioni la Santa Sede intrattiene relazioni di diverso tipo con numerose organizzazioni intergovernative.
La Santa Sede e l'Agenzia internazionale per l'energia atomica intrattengono relazioni bilaterali dal 1957.
La Santa Sede e l'Associazione delle Nazioni del Sud-est asiatico intrattengono relazioni bilaterali dal 18 giugno 2011.
La Santa Sede e il Comitato internazionale di medicina militare intrattengono relazioni bilaterali.
La Santa Sede e la Commissione internazionale dello stato civile intrattengono relazioni bilaterali dal 2014.
La Santa Sede e la Comunità caraibica intrattengono relazioni bilaterali dal 2015.
La Santa Sede e la Comunità economica degli Stati dell'Africa occidentale intrattengono relazioni bilaterali dal 2013.
La Santa Sede e il Consiglio d'Europa intrattengono relazioni bilaterali dal 7 marzo 1970.
La Santa Sede e l'Istituto internazionale per l'unificazione del diritto privato intrattengono relazioni bilaterali.
La Santa Sede e l'Organizzazione degli Stati Americani intrattengono relazioni bilaterali.
La Santa Sede e l'Organizzazione della Lega degli Stati Arabi intrattengono relazioni bilaterali dal 2000.
La Santa Sede e l'Organizzazione delle Nazioni Unite intrattengono relazioni bilaterali dal 1964.
La Santa Sede e l'Organizzazione delle Nazioni Unite per l'alimentazione e l'agricoltura intrattengono relazioni bilaterali dal 23 novembre 1948.
La Santa Sede e l'UNESCO intrattengono relazioni bilaterali dal maggio 1951.
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La Santa Sede e l'UNESCO intrattengono relazioni bilaterali.
La Santa Sede e l'Organizzazione internazionale per le migrazioni intrattengono relazioni bilaterali dal 2011.
La Santa Sede e l'Organizzazione mondiale del commercio intrattengono relazioni bilaterali dal 1997.
La Santa Sede e l'Organizzazione mondiale del turismo intrattengono relazioni bilaterali.
La Santa Sede e l'Organizzazione per l'applicazione del trattato per il bando completo degli esperimenti nucleari intrattengono relazioni bilaterali.
La Santa Sede e l'Organizzazione per la proibizione delle armi chimiche intrattengono relazioni bilaterali.
La Santa Sede e l'Organizzazione per la sicurezza e la cooperazione in Europa intrattengono relazioni bilaterali dal 1994.
La Santa Sede e il Programma delle Nazioni Unite per gli insediamenti umani intrattengono relazioni bilaterali dal 1997.
La Santa Sede nomina un proprio osservatore presso l'Ufficio delle Nazioni Unite e Istituzioni specializzate a Ginevra.
La Santa Sede nomina un proprio osservatore presso l'Ufficio delle Nazioni Unite e le istituzioni specializzate a Vienna.
La Santa Sede e l'Unione Africana intrattengono relazioni bilaterali dal 2003.
La Santa Sede e la Comunità Europea intrattengono relazioni bilaterali dal 1970.