Een histologische kleuring wordt gebruikt bij het histologisch onderzoek om weefsel en structuren beter te kunnen onderscheiden met een lichtmicroscoop. In de loop van de eeuwen heeft men een hele reeks van kleurstoffen ontdekt die zich specifiek aan bepaalde weefsel of delen daarvan binden. Dat heeft tot een beter begrip van onder andere de werking van cellen bijgedragen en kleuringen spelen nog steeds belangrijke een rol in bijvoorbeeld de diagnose van ziektes met behulp van de microscoop.
H Giemsa - bacteriën lichtblauw, verder alle nuances blauw
Toluidine-blauw - Kleurt verschillende zure componenten blauw.
Zilver-en-goudmethode - Gebruikt voor het kleuren van neuronen, motorische eindplaten en intercellulaire koppelingen. Kleurt het onderdeel zwart, bruin of goud.
Chroom alum/haematoxyline - Lijkt op H.E., alleen nuclei zijn blauw en cytoplasma is rood.
Isamine blauw/eosine - Lijkt op H.E., alleen met een intense blauwe kleur.