Trass i namnet, vart «Pale Blue Eyes» skriven om nokon med brune auge, som Reed skreiv i boka si Between Thought and Expression.[3] Songen skal ha vore inspirert av Shelley Albin, den første kjærasten til Reed, som på den tida var gift med ein annan mann.[4]
Lou Reed ønskte først å spele «Pale Blue Eyes» for den første samlinga til Velvet Underground i Fondation Cartier i 1990. Då nokon minna han om at han hadde skrive songen etter at John Cale slutta i bandet, sa Reed, «Då må det bli 'Heroin'».[5]
«Pale Blue Eyes» har blitt spelt av mange andre artistar[6] i tillegg til Lou Reed og Maureen Tucker frå Velvet Underground:
Patti Smith framførte songen på scenen frå 1960-åra og gjennom 1970-åra.
Edwyn Collins spelte inn songen med Paul Quinn og gav han ut på singel i 1984.
R.E.M. spelte inn songen som ei B-side til singelen «So. Central Rain», gjeve ut i 1984 og sidan i 1987 på albumet deira Dead Letter Office.
Marisa Monte spelte inn songen i 1994 på albumet hennar Verde, Anil, Amarelo, Cor de Rosa e Carvão (a.k.a. Rose and Charcoal).
Hole spelte inn songen på scenen på Whisky a Go Go i februar 1992 og frontkvinna Courtney Love introduserte han som «den originale new wave-songen».[7] Hole si utgåve kom sidan ut på den første EP-en deira, Ask for It (1995).
Alejandro Escovedo spelte eit konsertopptak av songen i ein duett med Kelly Hogan i 1999 på albumet Bourbonitis Blues.
Counting Crows spelte songen fleire gonger i 2003 og seinare.
The Kills spelte inn songen i 2010 og gav han ut som B-side tidleg i 2012.[8]