Inom biokemi är ett lyas ett enzym som kan katalysera spjälkningsreaktioner. Ett lyas bryter en kovalent bindning under bildande av en dubbelbindning eller en ny ringstruktur,[1] till skillnad från ett hydrolas (en substitutionsreaktion) som bryter en kovalent bindning under konsumtion av en vattenmolekyl. Den omvända reaktionen är också möjlig (kallad Michael-reaktion). Till exempel skulle ett ensym som katalyserar vara ett lyas:
- ATP → cAMP + PPi
Lyaser skiljer sig från andra enzymer genom att de endast kräver ett substrat för reaktionen i en riktning, men två substrat för den omvända reaktionen.
Nomenklatur
[redigera | redigera wikitext]Systematiska namn bildas som "Substratgrupp-LYAS". Vanliga namn innehåller dekarboxylas, dehydratas, aldolas etc. När produkten är viktigare kan syntas användas i namnet, till exempel fosfosulfolaktatsyntas (EC 4.4.1.19, Michael-addition av sulfit till fosfoenolpyruvat). En kombination av både en eliminering och en Michael-addition ses i O-succinylhomoserin (tiol)-lyas (MetY eller MetZ), som först katalyserar y-elimineringen av O-succinylhomoserin (med succinat som lämnande grupp) och sedan tillsätter sulfid till vinylmellanprodukten, klassificerades först som ett lyas (EC 4.2.99.9), men omklassificerades sedan som ett transferas (EC 2.5.1.48).
Klassificering
[redigera | redigera wikitext]Lyaser klassificeras som EC 4 i EG-nummerklassificeringen av enzymer. Lyaser kan ytterligare klassificeras i sju underklasser:
- EC 4.1 omfattar lyaser som klyver kol-kolbindningar, såsom dekarboxylaser (EC 4.1.1), aldehydlyaser (EC 4.1.2), oxosyralyaser (EC 4.1.3) och andra (EC 4.1.99)
- EC 4.2 omfattar lyaser som klyver kol-syrebindningar, som dehydrataser
- EC 4.3 omfattar lyaser som klyver kol-kvävebindningar
- EC 4.4 omfattar lyaser som klyver kol-svavelbindningar
- EC 4.5 omfattar lyaser som klyver kol-halidbindningar
- EC 4.6 omfattar lyaser som klyver fosfor–syrebindningar, som adenylylcyklas och guanylylcyklas
- EC 4.99 omfattar andra lyaser, såsom ferrochelatas
Membranförbundna lyaser
[redigera | redigera wikitext]Vissa lyaser är förbundna med biologiska membran som perifera membranproteiner eller förankrade genom en enda transmembranhelix.[2]
Referenser
[redigera | redigera wikitext]- Den här artikeln är helt eller delvis baserad på material från engelskspråkiga Wikipedia, Lyase, 1 februari 2023.
- EC 4 Introduction from the Department of Chemistry at Queen Mary, University of London
Noter
[redigera | redigera wikitext]- ^ ”Lyase”. www.uniprot.org. https://www.uniprot.org/keywords/456.
- ^ Superfamilies of single-pass transmembrane lyases in Membranome database
Externa länkar
[redigera | redigera wikitext]
Wikimedia Commons har media som rör Lyaser.
| |||||||||||||||||