17. Juli: Die in englischer Gefangenschaft befindliche schottische Königin Maria Stuart antwortet mutmaßlich auf einen Brief von Anthony Babington. Bis heute ist die Echtheit dieses Dokuments umstritten.
August: In England deckt Francis Walsingham die Babington-Verschwörung gegen Königin Elisabeth I. auf, in die auch Maria Stuart verwickelt ist. Die ersten sieben Verschwörer, unter ihnen Anthony Babington und John Ballard werden bereits am 20. September hanged, drawn and quartered. Elisabeth ist nach den Schilderungen der Hinrichtungen so entsetzt, dass sie für den nächsten Tag, an dem weitere sieben Verschwörer hingerichtet werden sollen, eine schnellere Hinrichtung befiehlt. Der Prozess gegen Maria Stuart, die Ende September nach Fotheringhay Castle verlegt wird und deren Korrespondenz nun genau überwacht wird, findet im Oktober statt. Am 25. Oktober wird sie des Hochverrats für schuldig befunden. Auf der Parlamentsversammlung vom 29. Oktober fordern Ober- und Unterhaus per Petition einstimmig die sofortige Hinrichtung. Elisabeth weigert sich jedoch bis Ende des Jahres, die ihr am 12. November in Richmond überreichte Petition zu unterschreiben.
2. März: Nach der Einnahme von Werl durch Martin Schenk von Nideggen im Truchsessischen Krieg bietet das Herzogtum Westfalen neben einigen Söldnern ein Landesaufgebot auf. Schenk zieht seinen Gegnern entgegen und schlägt das Aufgebot in der Schlacht bei Werl vernichtend. Die Niederlage bleibt jedoch ohne Folgen, da sich Schenk wegen anrückender Entsatztruppen zurückzieht.
5. Oktober: Die sieben katholischen Orte der Alten Eidgenossenschaft gründen den Goldenen Bund. Die Bündnispartner versprechen, beim alten Glauben zu bleiben, und geloben einander Hilfe bei Gefahren.
10. September: Unter der Regie des eidgenössischen Architekten Domenico Fontana wird vor dem Petersdom auf dem heutigen Petersplatz in Rom ein Obelisk aufgestellt. Papst Sixtus V. hat ihn aus dem Zirkus des Nero herbeitransportieren lassen.
10. Dezember: Höchster Stadtbrand: Von geschätzten 100 „Haushaltungen“ in Höchst am Main verbrennen 56 Häuser und 23 Scheunen. Das „Specht“ oder „Untertor“ genannte westliche Stadttor Richtung Mainz und das Rathaus werden ebenfalls zerstört.
Ein Ausbruch des Vulkans Kelut auf Java fordert rund 10.000 Todesopfer.
10. September: Hans Walther, deutscher Bildhauer und Bürgermeister von Dresden (* 1526)
11. September: Kaspar Arnurus, deutscher Moralphilosoph und Logiker (* um 1520)
15. September: Michael Teubner, deutscher Rechtsgelehrter (* 1524)
18. September: Ottavio Farnese, Herzog von Parma und Piacenza (* 1524)
20. September: Anthony Babington, englischer Adeliger, Hauptbeschuldigter der Babington-Verschwörung (* 1561)
20. September: John Ballard, englischer Jesuitenpriester und Drahtzieher der Babington-Verschwörung
21. September: Antoine Perrenot de Granvelle, Bischof von Arras, Erzbischof von Mechelen, Kardinalbischof von Sabina, Erzbischof von Besançon und Minister in den Spanischen Niederlanden (* 1517)
01. Oktober: Adolf I., Herzog von Schleswig-Holstein-Gottorf (* 1526)