Michel Cloet was de oudste van zeven en stamde uit een landbouwersfamilie (zijn vader Maurice Cloet was voorzitter van de plaatselijke Boerengilde). De naam Cloet kwam al vanaf de 16de eeuw in Pittem voor. Hijzelf trouwde met Christiane Mullie (°Tielt) en ze hebben twee zonen. Zij was directrice van de kinderdagverblijven van de Leuvense universiteit.
In dezelfde universiteit en faculteit werd Cloet achtereenvolgens monitor of studiebegeleider (1957-1967), lector (1968), docent (1973) en gewoon hoogleraar (1977). Hij werd emeritus in 1996 en hield op 26 oktober 1996 zijn afscheidscollege.
Het kerkelijk leven in een landelijke dekenij van Vlaanderen tijdens de XVIIe eeuw. Tielt van 1609 tot 1700, Leuven, 1968
Karel-Filips de Rodoan en het bisdom Brugge tijdens zijn episcopaat (1602-1616), Verhandelingen van de Koninklijke Vlaamse Academie voor Wetenschappen, Letteren en Schone Kunsten van België. Klasse der Letteren. Brussel, 1971.
Religious life in a rural deanery in Flanders during the seventeenth century. Tielt from 1609 to 1700, in: Acta historiae Neerlandica (1971), p.135-158.
Itinerarium visitationum Antonii Triest, episcopi Gandavensis, 1623-1654: de visitatiesverslagen van bisschop Triest, Leuven, 1976
Kerkelijke instellingen en het belang ervan voor de plaatselijke geschiedenis, 16de-18de eeuw, in: De Leiegouw, 25(1983), p. 3-31
Een onbekende catechismus van bisschop de Rodoan, 1602-1616, ontdekt in de British Libray, in: Brugs Ommeland, 23(1984), p.177-197
(i.s.m. B. Janssens de Bisthoven en R. Boudens) Het bisdom Brugge (1559-1984): bisschoppen, priesters, gelovigen, Brugge, 1984
Bisschop Triest op bezoek te Pamele (1624-1652), in: Historica Lovaniensia / Katholieke Universiteit Leuven. Departement Geschiedenis, vol. 189, 1985
La religion populaire dans les Pays-Bas méridionaux au XVIIe siècle, in: Revue du Nord, 67(1985), p.923-954
La religion populaire dans les Pays-Bas méridionaux au XVIIIe siècle, in: Revue du Nord, 68(1986), p. 609-634
De voornaamgeving in het hertogdom Brabant (17de-20ste eeuw): een bijdrage tot de mentaliteitsgeschiedenis, in: Historica Lovaniensia, vol.196, Leuven, 1986
(samen met anderen) Godsdienst, mentaliteit en dagelijks leven: religieuze geschiedenis in België sinds 1970, colloquium 23 en 24 september 1987 Religion, mentalité et vie quotidienne: histoire religieuse en Belgique depuis 1970, colloque 23 et 24 septembre 1987, Brussel, 1988 (Belgisch archief- en bibliotheekwezen).
(samen met anderen) Repertorium van dekenale visitatieverslagen betreffende de Mechelse kerkprovincie (1559-1801), Leuven, 1989
'samen met anderen) Tien bijdragen tot de lokale en regionale demografie in Vlaanderen, Brussel, 1989
Het decanaat Leuven in 1732-1734: visitatieverslag van deken Rombout Van Kiel, Brussel, 1990
(i.s.m. L. Collin en R. Boudens) Het bisdom Gent (1559-1991): vier eeuwen geschiedenis, Gent, 1991
(samen met anderen) Het vormsel, KADOC studies / Katholiek Documentatie- en Onderzoekscentrum [Leuven], Leuven, 1991
Een kwarteeuw historische productie in België betreffende de religieuze geschiedenis van de Nieuwe Tijd, in: Trajecta, 4(1995), p. 198-223
(samen met anderen) Geboorte en doopsel, KADOC studies / Katholiek Documentatie- en Onderzoekscentrum [Leuven],Leuven, 1996
(samen met anderen) Toernooi: quizboek over geschiedenis, Leuven, 1998
(samen met anderen) Het huwelijk, Katholiek Documentatie- en Onderzoekscentrum [Leuven], Leuven, 2000
De personalisering van de zielzorg na Trente. Ambities en realisaties in de Mechelse kerkprovincie, in: Trajecta, 9 (2000), p.3-27
De kerk en haar invloed in: (Paul Janssens, dir.), België in de 17de eeuw. De Spaanse Nederlanden en het prinsbisdom Luik. Band II: Cultuur en Leefwereld, Dexia Bank/Snoeck Gent, 2006, blz. 11-62 (ook in het Frans).
Het Sint-Blasiushospitaal te Deinze in de 17de en 18de eeuw, in: Bijdragen tot de geschiedenis van Deinze en de Leiestreek, 70(2003), p.147-214
(samen met anderen) Geschiedenis van Deinze, dln. 1 en 3, Deinze 2003, 2007
(samen met anderen) De geschiedenis van Tielt: een nieuwe kijk op een rijk verleden, Tielt, 2009
Valère ARICKX, Geschiedenis van Pittem, Pittem, 1951
Jan VAN DER HOEVEN, Michel Cloet, in: Lexicon van West-Vlaamse schrijvers, Deel 2, Torhout, 1985.
Raoul M. DE PUYDT, Michel Cloet, VWS-cahiers nr. 186, 1998.
Eddy PUT, Marie-Juliette MARINUS & Hans STORME, Geloven in het verleden: studies over het godsdienstig leven in de vroegmoderne tijd, aangeboden aan Michel Cloet, Leuven, 1996 (met uitgebreide bibliografie van de gevierde, o.a. 10 bijdragen over studiebegeleiding en didactiek)
André VANDEWALLE, Michel Cloet in het Genootschap. Een steunpilaar, in: Handelingen van het Genootschap voor Geschiedenis te Brugge, 2012, blz. 217-221.
Dries VANYSACKER, Bibliografie Michel Cloet (1996-2012), in: Handelingen van het Genootschap voor Geschiedenis te Brugge, 2012, blz. 222-224.
