A Medalha Pedro Ernesto foi criada através da Resolução nº 40, em 20 de outubro de 1980. Ela é a principal homenagem que o Rio de Janeiro presta a quem mais se destaca na sociedade brasileira ou internacional. Recebeu esse nome em reconhecimento ao trabalho do prefeito Pedro Ernesto, e por isso, sua figura é estampada nas duas Medalhas que fazem parte do Conjunto. Uma presa ao colar e a outra para ser colocada na lapela do homenageado. Ambas são presas em uma fita de cores azul, vermelha e branca que são as cores da bandeira da cidade,[1] a mais alta condecoração concedida pela Câmara Municipal do Rio de Janeiro.[2]
Foi severamente questionada em 2006, depois que o ex-deputado Roberto Jefferson, réu confesso e cassado por participar do esquema do mensalão, foi condecorado com ela por sua própria filha, a vereadora Cristiane Brasil. O cartunista Jaguar devolveu sua medalha, entregue oito anos antes pelo então vereador Chico Alencar.[3]
Também levam o nome do histórico prefeito o Hospital Universitário Pedro Ernesto, uma rua no bairro carioca da Gamboa e uma escola municipal situada no bairro da Lagoa. Em 2009, sua memória foi lembrada no desfile da escola de samba Unidos de Cosmos.