La resistenza multifarmaco è un fenomeno caratterizzato dalla contemporanea resistenza di elementi patogeni verso antibiotici con diversa struttura e diversa modalità d'azione.
Alcune resistenze possono svilupparsi in seguito a mutazioni genetiche.
Alcuni elementi patogeni che mostrano resistenza multifarmaco sono la Neisseria gonorrhoeae e lo Staphylococcus aureus.